ms-bio.info

講演動画

　質量分析インフォマティクス研究会では、実施したワークショップやJSBi年会のセッションなどでの講演を、講師の先生から許可をいただいた場合に限って撮影し、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) の運営する 統合TVのコンテンツとしてYouTube上で公開しています。ここにはその全動画へのリンクを集めています。（講師氏名敬称略）

第2回公開ワークショップ（2017年2月24日）

• 津川 裕司 （理研CSRS・IMS）　質量分析を用いたメタボロミクス研究に資する情報処理および化合物同定のための技術開発　（42分）［メタボロミクス，ソフトウェア］


• 山本 博之 （HMT）　CE-MSメタボロミクスにおけるバイオ/ケモ/質量分析インフォマティクス　（42分）［メタボロミクス，ケモインフォマティクス］


• 早川 英介 （OIST）　MS/MSスペクトルクラスタリングの化合物構造推定への応用　（37分）［ケモインフォマティクス，質量分析］


• 箕輪 真理 （DBCLS）　オミクス・データと個人情報　（25分）［生命倫理，法規制］

IIBMP2017（JSBi2017年会）BoFセッション（2017年9月28日）

• 山本 博之 （HMT）　メタボロミクスにおけるケモインフォマティクス - 代謝物構造推定への応用　（11分）［メタボロミクス，ケモインフォマティクス］


• 田中　聡 （Trans-IT）　質量分析を取り巻くソフトウェアの現状　（18分）［ソフトウェア，質量分析］

第3回公開ワークショップ（2018年4月23日）

• 小寺　義男　Native peptide研究の現状と課題　（46分）［ペプチドミクス，質量分析］


• 河野　信 （DBCLS）　PSI meeting 2018 最新報告　（24分）［プロテオミクス，質量分析，標準化］

第2回ハッカソン・シンポジウム（2018年7月15日）

• 五斗 進 （DBCLS）　DBCLS/NBDCが提供するデータベースとツールの紹介　（15分）［ソフトウェア，データベース，ゲノム解析，入門］


• 片山 俊明 （DBCLS）　セマンティック・ウェブによるゲノムデータベース構築　（16分）［RDF，データベース，ゲノム解析，入門］


• 守屋 勇樹 （DBCLS）　プロテオーム統合データベース jPOST の紹介　（15分）［データベース，プロテオミクス，入門］


• 津川 裕司 （理研CSRS・IMS）　質量分析データの構造と読み方およびピーク検出方法　（14分）［質量分析，メタボロミクス，入門］


• 早川 英介 （OIST）　質量情報と化合物情報の連携　（16分）［メタボロミクス，ケモインフォマティクス，入門］


• 山本 博之 （HMT）　多変量解析を用いたメタボロームデータ解析　（16分）［メタボロミクス，統計解析，入門］


• 小林 大樹 （熊本大）　質量分析によるプロテオーム解析　（14分）［プロテオミクス，入門］　講演スライド


• 加藤 雅樹 （基生研）　グライコプロテオミクス　（14分）［グライコミクス，グライコプロテオミクス，入門］


• 渡辺 由 （新潟大）　リポジトリサービスの開発とデータ転送　（12分）［ソフトウェア，データベース，入門］


• 田中 聡 （Trans-IT）　質量分析データ表示ツール Mass++　（13分）［ソフトウェア，質量分析，入門］

第1回メタボロミクスソフトウェア技術講習会（2018年11月12日）

本講習会は、国立遺伝学研究所DDBJセンター（現　生命情報・DDBJセンター）によるD-STEP講習会と合同で開催されたものです。

講演資料・教材ダウンロードページ

• 津川 裕司 （理研CSRS）　GC-MS データの前処理から化合物同定・データのキュレーション方法　（68分）［質量分析，メタボロミクス，入門］


• 津川 裕司 （理研CSRS）　LC-MS/MS を用いたノンターゲットリピドミクスとデータ解釈法　（54分）［質量分析，メタボロミクス，入門］


• 津川 裕司 （理研CSRS）　LC-MS/MS を用いた親水性代謝物のプロファイリングとデータ解釈法　（46分）［質量分析，メタボロミクス，入門］


• 津川 裕司 （理研CSRS）　未知マススペクトルからの構造推定方法と演習　（30分）［質量分析，メタボロミクス，入門］


• 山本 博之 （HMT）　多変量解析の背景理論の説明（講義形式）　（34分）［メタボロミクス，統計解析，入門］


• 櫻井 望 （遺伝研DDBJセ）　多変量解析演習（主成分分析・PLS-DA・PLS 回帰）　（50分）［メタボロミクス，統計解析，入門］

第4回公開ワークショップ（2019年3月19日）

• 福島 敦史（理研CSRS）　質量分析を用いた植物メタボロミクスデータの情報解析と共有　（36分）［メタボロミクス，データベース，植物］


• 野田 修平（理研CSRS）　有用バルクケミカル合成大腸菌プラットフォーム開発における質量分析機器の活用　（28分）［代謝工学，メタボローム，質量分析］


• 沖 真弥（九大医）公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む　（31分）［ChIP-Seq，データベース，エピゲノミクス］

第2回メタボロミクスソフトウェア技術講習会（2019年11月11日）

• 多田 一風太 （遺伝研）　Data independent acquisition を用いたメタボローム解析　（41分）［メタボロミクス，質量分析］


• 早川 英介 （OIST）　未知化合物アノテーションのための質量分析データのネットワーク解析法〜講義編〜　（48分）［メタボロミクス，質量分析］


• 津川 裕司（理研CSRS）　未知化合物アノテーションのための質量分析データのネットワーク解析法〜実習編〜　（69分）［メタボロミクス，質量分析］

第5回公開ワークショップ（2020年8月7日）

• 五斗 進 （ROIS DS DBCLS）　データベースから見た質量分析インフォマティクスとバイオインフォマティクス　（40分）［バイオインフォマティクス，データベース，セマンティクス］


• 蓮沼 誠久 （神戸大先端バイオ）　バイオ×デジタルの技術融合による有用微生物「スマートセル」開発への挑戦　（35分）［代謝工学，メタボローム，質量分析］


• 三浦 信明（新潟大院医歯学）質量分析から見るグライコームの夢　―グライコミクスのインフォマティクスとマルチオミックスへの取り組み　（33分）［グライコミクス，質量分析，データベース］


• 福崎 英一郎（阪大院工）メタボロームを代謝指紋とした表現型解析　（30分）［メタボロミクス，質量分析，分析化学］


• 石濱 泰（京大院薬）プロテオームデータのインテリジェント解析とデータベース化　（34分）［プロテオミクス，機械学習，質量分析］

第6回公開ワークショップ（2021年6月10日）

• 大野 聡 （東大院理）　脂肪細胞におけるインスリン依存性糖代謝の速度論的トランスオミクス解析　（37分）［トランスオミクス，システム生物学］


• 馬場 健史・中尾 素直 （九大生体防御）　定量メタボロームデータ取得に向けた分析技術およびソフトウエア開発　（38分）［メタボロミクス，質量分析，分析化学］


• 実践プロトコールセッション「メタボロミクスデータ解析」
• 津川 裕司（農工大院GI／理研／横浜市立大）メタボロミクスに資する質量分析データ処理プロトコール　（21分）［メタボロミクス，質量分析］


• 早川 英介（OIST）質量分析インフォマティクスによる未知化合物のアノテーション　（25分）［メタボロミクス，質量分析，アノテーション］


• 山本 博之 （HMT）MetaboAnalystを用いた主成分分析とエンリッチメント解析　（16分）［メタボロミクス，統計解析］


• 西田 孝三（理研BDR）トランスオミクス解析のための多階層パスウェイ可視化の自動化　（15分）［トランスオミクス，パスウェイ解析］

第3回メタボロミクスソフトウェア技術講習会（2021年7月1日）

• 津川 裕司（農工大院GI）　天然物MS/MSアノテーションの事例紹介 (Medicagenic acid O-malonyl hexose)　（17分）［メタボロミクス，質量分析］


• 山本 博之 （HMT）　キャピラリー電気泳動－飛行時間型質量分析計を用いたメタボロミクスにおける未同定ピークの構造推定の一例　（20分）［メタボロミクス，質量分析］


• 荒 武 （京大生存研）　天然物MS/MSアノテーションの事例紹介 (Dehydro carpamic acid glycoside)　（7分）［メタボロミクス，質量分析］


• 櫻井 望（遺伝研）　ノンターゲットメタボローム解析でオカラミンを同定した方法　（19分）［メタボロミクス，質量分析］

第7回公開ワークショップ（2022年4月22日）

• 草野 博彰 （京大生存圏研）　生データの目視でメタボロミクスをするためのツールGrassHopperのご紹介　（40分）［メタボロミクス，質量分析］


• 金谷 重彦 （奈良先端大情報科学）　KNApSAcK Family DB：閉鎖まであと6年、それでも頑張るDB構築！　（48分）［メタボロミクス，データベース］


• データ解析セッション「プロテオミクスデータ解析」
• 早川 英介（OIST）プロテオミクスデータの素性と扱い方　-RAWから始まるデータ解析-　（25分）［プロテオミクス，質量分析］


• 吉沢 明康 （富山国際大）質量情報から配列情報へ－どこまで信頼できるのか　（27分）［プロテオミクス，質量分析，統計］


• 三浦 信明（新潟大医歯学）大規模データベースサーチの憂鬱　（21分）［プロテオミクス，データベース，統計］


• 岩崎 未央（京大CiRA）2022年現状のプロテオーム定量解析手法 -single cell解析からbulk解析まで-　（28分）［プロテオミクス，分析化学，アルゴリズム］


• 奥田 修二郎（新潟大医）プロテオームデータの登録・公開　（18分）［プロテオミクス，データベース］

Page Last Updated: Oct. 27, 2022