2017年ハッカソン・プレミーティング
当初の予定では、ハッカソン初日は「質量分析インフォマティクス・ハッカソン」に(こちらをメインとして)参加した参加者の間で、「どのようなテーマに取り組むか」を議論することを想定していました。
しかし、
- 事前に自由に記入していただいてきた公開webページ・「課題」ページに、既にかなりの記入があること
- 「国内版バイオハッカソンBH17.11」として申し込んでいるが初日ミーティングには参加したい、としている参加者が、質量分析インフォマティクス・ハッカソン側とほぼ同数いること
から、初日の予定を見直して、一連の講演(会)を企画しました。具体的には、
- 「質量分析関係分野の研究者で、インフォマティクスや情報処理に詳しくない人」向けの入門的内容(特にDBCLSが公開しているバイオインフォマティクス・ツールについて)
- 「バイオインフォマティクス(非質量分析分野)の研究者で、質量分析について詳しくない人」向けの入門的内容
を、8人の先生方にご講演いただきます。各先生方10~15分の簡単なものですが、それぞれの分野の“初心者”の方にも、また経験者の方にも、有益なものであると確信しております。
また会の最初には、参加者全員で(20秒程度ずつ)自己紹介(自分の興味のあるテーマについての紹介を含む)をする予定です。この情報は、講演者が講演内容を微調整するのに参考にされると同時に、講演に引き続いて行う予定の「各自のテーマの検討」で、参加者同士が互いの興味の対象を知るための手掛かりにすることを意図しています。
本ミーティングが、質量分析系・情報系の参加者の間でのコラボ、特に今回のハッカソンでのコラボが進んでいくことの一助になれば幸いです。
初日スケジュール
時間帯 | 担当者(敬称略) | 概要 | |
---|---|---|---|
13:00~14:00 | オーガナイザー | 参加者受付 | |
14:00~14:10 | オーガナイザー | 挨拶、当日の予定告知 | |
14:10~14:30 | 参加者全員 | 参加者全員の自己紹介(&興味の対象紹介)[各自20秒程度] | |
14:30~14:40 | 五斗 進 | (DBCLS) | 統合DB概要 |
14:40~14:50 | 守屋 勇樹 | (DBCLS) | TogoGenome(など)(事例紹介) |
14:50~15:00 | 河野 信 | (DBCLS) | TogoTable(など)(事例紹介) |
15:00~15:15 | 早川 英介 | (OIST) | 質量分析、メタボローム |
15:15~15:30 | 小林 大樹 | (熊本大) | 質量分析、プロテオーム |
15:30~15:45 | 加藤 雅樹 | (京都大) | グライコプロテオーム |
15:45~15:55 | 渡辺 由 | (新潟大) | データベース関連技術(事例紹介) |
15:55~16:05 | 田畑 剛 | (京都大) | 解析ツール(事例紹介) |
16:05~16:15 | 休憩 | ||
16:15~17:00 | 参加者全員 | 分野の課題・討論 | |
17:00~18:00 | 参加者全員 | 各参加者の課題・打ち合わせ | |
18:00~21:00 |
レセプション (国内版バイオハッカソンと合同) |
||
21:00~ | (いや、お好きに) |
※ インフォマティクスの啓蒙的講演には演習時間がつきものですが、今回はこの後レセプションが、そして翌日からハッカソンがあり講師の方も参加されますので、原則として質問や演習の時間は設けないことにします。
講師所属先(敬称略、講演順)
五斗 進 情報・システム研究機構(ROIS) データサイエンス共同利用基盤施設(DS) ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
守屋 勇樹 情報・システム研究機構(ROIS) データサイエンス共同利用基盤施設(DS) ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
河野 信 情報・システム研究機構(ROIS) データサイエンス共同利用基盤施設(DS) ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
早川 英介 沖縄科学技術大学院大学(OIST)
小林 大樹 熊本大学 大学院生命科学研究部(医学部)
加藤 雅樹 京都大学 大学院薬学研究科
渡辺 由 新潟大学 大学院医歯学総合研究科
田畑 剛 京都大学 大学院薬学研究科/京都大学 iPS細胞研究所
本ミーティングの開催にあたっては、ハッカソン本体の日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)及び加藤記念バイオサイエンス振興財団からの助成に加えて、
情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設による公募型共同研究(共同研究集会)
ROIS-DS-JOINT(006RM2017)[採択者:吉沢明康]
の助成を受けています。
Page Last Updated: Nov. 25, 2017